炎症过程的病理表现主要源于促炎细胞因子的过度释放，其中IL-1β是关键的细胞因子。IL-1β的过量存在会破坏免疫信号传导，从而在许多炎症疾病的病理生理学中发挥致病和加重作用。调节IL-1β水平至关重要，而IL-1Ra分子通过与IL-1R1受体结合，从而阻碍IL-1β的结合，从而达到调节IL-1β水平的目的。目前已有多种药物上市，旨在通过多种机制来中和IL-1β的生物学功能。然而，现有的IL-1β抑制剂是重组蛋白，其生产成本高且稳定性有限。因此，本研究旨在预测一种基于IL-1Ra分子的肽，命名为DAP1-2。DAP1-2旨在通过阻断IL-1R1受体来减弱IL-1β引发的反应。使用SwissPDBViewer从IL-1Ra分子(PDB:I1RA)中筛选出与IL-1R1受体三个结构域相互作用的氨基酸。预测后，使用Fmoc-Synthesis技术进行化学合成。使用RAW264.7细胞评估DAP1-2的疗效。将RAW264.7细胞暴露于LPS(5μg/mL)24小时以诱导IL-1β表达，并用不同浓度的肽处理。使用ELISA评估IL-1β水平，并通过RT-qPCR测量IL-1β的基因表达，此外还进行了活力测试。结果显示，在LPS刺激并用不同浓度的DAP1-2处理的细胞中，IL-1β水平和基因表达显著降低。此外，MTT分析证实了这些肽对细胞谱系无毒。由于使用合成肽具有稳定性、易于生产和成本效益，这种替代方法显示出作为IL-1抑制剂的前景。

单字母 H2N-ADPQNRLELNQYNQWRDEQYVK-OH

多字母 H2N-Ala-Asp-Pro-Gln-Asn-Arg-Leu-Glu-Leu-Asn-Gln-Tyr-Asn-Gln-Trp-Arg-Asp-Glu-Gln-Tyr-Val-Lys-OH

氨基酸个数 22

分子式 C122H183N37O40

平均分子量(MW) 2807.98
该肽被命名为DAP1-2，其设计基于与IL-1R1受体结构域1和2相互作用的氨基酸。共筛选出22个氨基酸，包括3个结合氨基酸（Pro130、Glu44和Val18）。DAP1-2序列如下：Ala127-Asp128-Pro130-Gln29-Asn27-Arg26-Leu25-Glu44-Leu42-Asn39-Gln36-Tyr34-Asn19-Gln20-Trp16-Arg14-Asp151-Glu150-Gln149-Tyr147-Val18-Lys145。筛选出氨基酸后，对其进行了理化性质测定。结果表明，分子量为2807.98 g/mol，等电点为4.44，水溶性良好，不稳定指数为8.18，属于稳定状态。

参考文献：doi.org/10.1007/s12026-024-09485-6