核定位信号肽(NLS肽) 具有NLS序列且能通过与核膜上的NLS受体识别,定位于核区的多肽称为NLS肽,NLS序列分为经典核定位信号序列(cNLS) 和非经典核定位信号序列(ncNLS),cNLS是指含有1组或2组碱性氨基酸的序列,通常是富含赖氨酸K和精氨酸R的K-(K/R)-X-(K/R)序列,其介导的入核过程,通常需要输入蛋白-α / β(improtin-α/β) 的共同参与,而ncNLP 不具备上述序列特征,并且其入核主要通过与improtin-β家族受体的直接识别,不需要improtin-α的参与, cNLP常见序列整理如下。
经典核定位信号(NLS):研究最为透彻的序列组成和运输机制,也是NLS中种类最为广泛的类型。Importin-α/β:Importin-α识别NLS,而Importin-β负责与核孔复合体对接并穿过核孔进行转运。
Pep1 单字母H2N-PKKKRKV-OH
多字母 H2N-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val-OH
氨基酸个数 7
分子式 C40H78N14O8
平均分子量(MW)883.14
Pep2 单字母H2N-GKKRSKV-OH
多字母 H2N-Gly-Lys-Lys-Arg-Ser-Lys-Val-OH
氨基酸个数 7
分子式 C34H67N13O9
平均分子量(MW)801.98
Pep3 单字母H2N-KSRKRKL-OH
多字母 H2N-Lys-Ser-Arg-Lys-Arg-Lys-Leu-OH
氨基酸个数 7
分子式 C39H78N16O9
平均分子量(MW) 915.14
Pep4 单字母H2N-RRKRQR-OH
多字母 H2N-Arg-Arg-Lys-Arg-Gln-Arg-OH
氨基酸个数 6
分子式 C35H70N20O8
平均分子量(MW)899.06
Pep5 单字母H2N-RKKRKTEEESLKDKAKKSK-OH
多字母 H2N-Arg-Lys-Lys-Arg-Lys-Thr-Glu-Glu-Glu-Ser-Leu-Lys-Asp-Lys-Ala-Lys-Lys-Ser-Lys-OH
氨基酸个数 19
分子式 C98H181N33O31
平均分子量(MW)2317.69
Pep6 单字母H2N-YLYQETNKVETYKEQPLKTPGKP-OH
多字母 H2N-Tyr-Leu-Tyr-Gln-Glu-Thr-Asn-Lys-Val-Glu-Thr-Tyr-Lys-Glu-Gln-Pro-Leu-Lys-Thr-Pro-Gly-Lys-Pro-OH
氨基酸个数 23
分子式 C126H196N30O39
平均分子量(MW)2755.08
Pep7 单字母H2N-SANKVTKNKSNSSPYLNKRKGKPGPDS-OH
多字母 H2N-Ser-Ala-Asn-Lys-Val-Thr-Lys-Asn-Lys-Ser-Asn-Ser-Ser-Pro-Tyr-Leu-Asn-Lys-Arg-Lys-Gly-Lys-Pro-Gly-Pro-Asp-Ser-OH
氨基酸个数 27
分子式 C123H208N40O41
平均分子量(MW)2903.21
Pep8 单字母H2N-MAPSAKATAAKKAVVKGTNGKKALKVRTSATFRLPKTLKLAR-OH
多字母 H2N-Met-Ala-Pro-Ser-Ala-Lys-Ala-Thr-Ala-Ala-Lys-Lys-Ala-Val-Val-Lys-Gly-Thr-Asn-Gly-Lys-Lys-Ala-Leu-Lys-Val-Arg-Thr-Ser-Ala-Thr-Phe-Arg-Leu-Pro-Lys-Thr-Leu-Lys-Leu-Ala-Arg-OH
氨基酸个数 42
分子式 C196H351N61O51S1
平均分子量(MW)4410.33
Pep9 单字母H2N-VHSHKKKKIRTSPTFTIPKTLTLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHY-OH
多字母 H2N-Val-His-Ser-His-Lys-Lys-Lys-Lys-Ile-Arg-Thr-Ser-Pro-Thr-Phe-Thr-Ile-Pro-Lys-Thr-Leu-Thr-Leu-Arg-Arg-Gln-Pro-Lys-Tyr-Pro-Arg-Lys-Ser-Ala-Pro-Arg-Arg-Asn-Lys-Leu-Asp-His-Tyr-OH
氨基酸个数 43
分子式 C234H391N77O58
平均分子量(MW)5211.09
Pep10 单字母H2N-ALNQSSNPGPMKGGNPGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGY-OH
多字母 H2N-Ala-Leu-Asn-Gln-Ser-Ser-Asn-Pro-Gly-Pro-Met-Lys-Gly-Gly-Asn-Pro-Gly-Gly-Arg-Ser-Ser-Gly-Pro-Tyr-Gly-Gly-Gly-Gly-Gln-Tyr-Phe-Ala-Lys-Pro-Arg-Asn-Gln-Gly-Gly-Tyr-OH
氨基酸个数 40
分子式 C169H255N55O55S1
平均分子量(MW)3969.23
参考文献:
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